Az új skizofrénia-tanulmány a fehérje-fehérje kölcsönhatásokra összpontosít
Az emberekhez hasonlóan sok mindent meg lehet tudni egy génről, ha megnézzük a társaságot, amelyet tart, és figyeljük, hogyan viselkedik. A skizofrénia kialakulásával kapcsolatos további nyomok feltárása érdekében a Pittsburghi Egyetem Orvostudományi Egyetem kutatói feltárták, hogy a skizofréniával kapcsolatos gének által termelt fehérjék hogyan hatnak egymással.
"Arra a következtetésre juthatunk, hogy a fehérje mit tehet, ha megvizsgáljuk az általa vezetett vállalatot." - mondta Madhavi Ganapathiraju, Ph.D. vezető kutató, a Pitt Orvostudományi Kar biomedicina informatikai adjunktusa.
- Például, ha tudom, hogy sok barátja van, aki hokizik, az azt jelentheti, hogy Ön is részt vesz a jégkorongban. Hasonlóképpen, ha azt látjuk, hogy egy ismeretlen fehérje kölcsönhatásba lép például az idegi jelátvitelben részt vevő több fehérjével, nagy a valószínűsége annak, hogy az ismeretlen entitás is részt vesz ebben. "
A közelmúlt történetében a tudósok számos, az egész genomra kiterjedő társulási vizsgálatot (GWAS) végeztek, amelyek sikeresen azonosították a skizofrénia fokozott kockázatához kötődő génvariánsokat. A kutatók szerint azonban viszonylag keveset tudnak azokról a fehérjékről, amelyeket ezek a gének előállítanak, mit csinálnak és hogyan hatnak egymásra.
"A GWAS-tanulmányok és más kutatási erőfeszítések megmutatták, milyen gének lehetnek relevánsak a skizofrénia esetében" - mondta Ganapathiraju. „Amit tettünk, az a következő lépés. Megpróbáljuk megérteni, hogy ezek a gének hogyan viszonyulnak egymáshoz, ami megmutathatja nekünk a betegség szempontjából fontos biológiai utakat. "
Dióhéjban mindegyik gén fehérjéket termel, és ezek a fehérjék jellemzően kölcsönhatásba lépnek egymással egy biológiai folyamat során. Megvizsgálva, hogy ezek a fehérjék hogyan viselkednek egymással, rávilágíthat egy még nem vizsgált gén szerepére, feltárva a skizofréniához kapcsolódó útvonalakat és biológiai folyamatokat, valamint annak kapcsolatát más összetett betegségekkel.
Az új számítási modell kifejlesztése és használata, a High-Precision Protein Interaction Prediction (HiPPIP) elnevezéssel a kutatók több mint 500 új fehérje-fehérje kölcsönhatást (PPI) fedeztek fel, amelyek a skizofréniához kapcsolódó génekhez kapcsolódnak.
A kutatók hozzáteszik, hogy bár a szkizofréniához kapcsolódó, a történelem során azonosított gének és a GWAS révén kevés átfedés mutatkozott, a modell azt mutatta, hogy több mint 100 közös interaktorral rendelkeznek. A megállapítások e mentális betegség biológiai alapjainak jobb megértéséhez vezethetnek, valamint utat mutathatnak a kezelésekhez.
A megállapításokat online publikáljuk npj skizofrénia, a Nature Publishing Group folyóirat.
Forrás: Pittsburghi Egyetem Egészségtudományi Iskolái
