Az autizmussal küzdőknél valószínűleg hiányoznak a gének
Ez azt jelenti, hogy ezeknek az egyéneknek - a vizsgálati csoport 7 százaléka - volt egy vagy több gén egy példánya, amikor kettőnek kellett volna lenniük - jegyezték meg a kutatók a New York-i Sínai-hegyi Icahn Orvostudományi Iskolában.
"Ez az első megállapítás, hogy az egy vagy két gént érintő kismértékű deléciók általánosnak tűnnek az autizmusban, és ezek a deléciók hozzájárulnak a rendellenesség kialakulásának kockázatához" - mondta a tanulmány vezető kutatója, Joseph D. Buxbaum, Ph.D. , a pszichiátria, a genetika és a genomikus tudományok és az idegtudományok professzora.
"Ezt a következtetést ki kell bővíteni az ASD más független mintáiban, hogy valóban megértsük, hogyan nyilvánul meg a kockázat."
Ez a folyamat Buxbaum szerint jelenleg is tart. A több mint 25 intézményből álló Autizmus Sequencing konzorcium 7 millió dolláros támogatást kapott az Országos Egészségügyi Intézetektől, hogy folytassa az ASD-k ezreinek genomjának elemzését a Sínai-hegyen.
Az autizmus, amely a lakosság körülbelül 1 százalékát érinti, olyan fejlődési rendellenesség, amelyet feltehetően genetikai és környezeti tényezők komplex kölcsönhatása okoz. Bár a rendellenesség öröklődhet, az autista esetek többsége nem tulajdonítható ismert öröklődő okoknak Buxbaum szerint.
Míg a kutatások azt mutatták, hogy akár 1000 olyan gén vagy genomi régió is hozzájárulhat az autizmushoz, a legtöbb tanulmány vagy egypontos mutációkat keresett - egy DNS egyetlen betűjének változását egy génen - vagy a genom nagy területeit , amely sok gént tartalmaz, ez megváltozott.
Tanulmányukhoz a kutatók génszekvenálási technológiával több száz egyed genomját vizsgálták át. Kis példányszám-variációt - a gének törlését vagy megkettőzését - kerestek az autizmussal élő egyének és a rendellenesség nélküli emberek kontrollcsoportja között.
A vizsgálat elvégzéséhez exome szekvenálást alkalmaztak, hogy megvizsgálják a mintakészlet mind a 22 000 emberi génjét. Ezután elemezték ezeket az adatokat az eXome Hidden Markov Model (XHMM) program segítségével. A kutatók szerint együtt az eszközök az elsők, amelyek egyetlen gén nagyságú deléciót vagy addíciót találnak a genomban.
"Ez lehetőséget ad nekünk arra, hogy először egy vizsgálatot futtassunk le egy vérmintából, és összehasonlítsuk egy referencia genommal, hogy mutációkat és kis kópiaszám-variációt keressünk a betegeknél" - magyarázta Buxbaum.
A kutatók 431 autista esetet és 379 egyeztetett kontrollt tartalmazó adatbázist elemeztek, összesen 811 egyént. 803 géndeléciót találtak az autista csoportban és 583 géndeléciót a kontroll csoportban. Azt is megállapították, hogy az autizmussal élők nagyobb valószínűséggel többszörösen kis törléseket szenvednek.
"Ma már ismert, hogy a tökéletlen gén kópiaszám az emberek közötti variabilitás egyik fő forrása" - mondta Buxbaum.
„Az egyik oka annak, hogy különbözünk egymástól, a gén addíciók vagy deléciók miatt van, amelyek gyakran öröklődnek. De az ASD-ben látott extra deléciók közül nem minden a genetikai öröklődésnek köszönhető. Néhány a petesejt vagy a sperma fejlődése során fordul elő, és az ily módon kialakuló deléciók általában a rendellenességgel társulnak. "
A kutatók azt találták, hogy az autizmussal élők géndelécióinak jelentős része összefüggésben van az autofágiával, amely folyamat a membránok és organellák helyettesítésével egészségesen tartja a sejteket.
"Megalapozott annak a feltételezése, hogy az autofágia valóban fontos az agy fejlődése szempontjából, mert az agy sokkal több szinapszist produkál, mint amennyire szüksége van, és a felesleget vissza kell metszeni" - mondta Buxbaum. „Túl sok vagy túl kevés szinapszis ugyanolyan hatással jár, hogy a kommunikáció nem működik nagyon jól. Ez azt jelentheti, hogy egyes szinaptikus kapcsolatok túl későn jönnek be, és nem biztos, hogy megszilárdulnak megfelelően. ”
A kutatók szerint elhiszik a American Journal of Human Geneticsklinikai jelentősége lesz.
"A legfontosabb példányszám-variációk - azok, amelyek következetesen megjelennek egy autista populációban - befolyásolhatják a genetikai tesztelést" - fejezte be Buxbaum.
Forrás: A Sínai-hegyi kórház / Sínai-hegyi Orvostudományi Iskola
